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國家知識產(chǎn)權(quán)局局長令
第十五號
根據(jù)中國專利行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)在制定中要為社會公眾服務(wù)、為國家宏觀決策服務(wù)、為行業(yè)管理部門管理服務(wù)的指導(dǎo)思想,依據(jù)專利法實施細(xì)則第18條第4款的規(guī)定,特制定《核苷酸和/或氨基酸序列表和序列表電子文件標(biāo)準(zhǔn)》,現(xiàn)予公布,自二○○一年十一月一日起施行。
局 長 王景川
二○○一年十一月一日
ZC
中華人民共和國知識產(chǎn)權(quán)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)
ZC 0003—2001
核苷酸和/或氨基酸序列表
和序列表電子文件標(biāo)準(zhǔn)
2001-11-01發(fā)布 2001-11-01實施
中華人民共和國國家知識產(chǎn)權(quán)局 發(fā)布
核苷酸和/或氨基酸序列表和序列表電子文件標(biāo)準(zhǔn)
1 總則
根據(jù)專利法實施細(xì)則第18條第4款的規(guī)定,包含一個或多個核苷酸或者氨基酸序列的發(fā)明專利申請,說明書中應(yīng)當(dāng)包括符合國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局規(guī)定的序列表,并按照國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局的規(guī)定提交含有該序列表的計算機(jī)可讀形式的副本。
為了使提交的紙件形式的核苷酸和/或氨基酸序列表及計算機(jī)可讀形式的含有該序列表的電子文件規(guī)范化,以利于申請人提交;也為了使序列表電子文件可以快捷地輸入國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局的計算機(jī)數(shù)據(jù)庫,并與其它的序列檢索數(shù)據(jù)庫交換數(shù)據(jù),以利于公眾檢索;同時也利于專利局審查員加快審查,更好地為申請人服務(wù);特制定本標(biāo)準(zhǔn)。
2 適用范圍
本標(biāo)準(zhǔn)適用于所有向國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局提交的包含核苷酸和/或氨基酸序列的發(fā)明專利申請,具體地說,適用于該申請?zhí)峤坏募埣问降暮塑账岷?或氨基酸序列表,以及含有核苷酸和/或氨基酸序列表的計算機(jī)可讀形式的序列表電子文件。
3 術(shù)語和定義
在本標(biāo)準(zhǔn)中,采用下面術(shù)語和定義:
(1)序列表:是指以紙件形式提交的專利申請說明書的一部分,它公開了核苷酸和/或氨基酸序列的詳細(xì)內(nèi)容和其它有用信息。序列表中的序列是不少于10個核苷酸的非支鏈核苷酸序列,或者是不少于4個氨基酸的非支鏈氨基酸序列。所述的序列不包括支鏈序列;不包括具有少于4個特別定義的核苷酸或氨基酸的序列;也不包括含有列于附錄1之表1-4以外的核苷酸或氨基酸的序列。
(2)序列表電子文件:是指包含核苷酸和/或氨基酸序列表的計算機(jī)可讀形式的純文本文件。
(3)核苷酸:只包括附錄1之表1中列出的符號所表示的核苷酸。附錄1之表2中列出的符號用于表述核苷酸的修飾形式,例如甲基化堿基。對于核苷酸的修飾形式,不得在核苷酸序列中直接使用表2中的符號表示,其具體的表述方式見本標(biāo)準(zhǔn)4.4.7節(jié)(1)和4.4.5節(jié)的內(nèi)容。
(4)氨基酸:只包括列于附錄1之表3中的存在于天然蛋白質(zhì)中的L-氨基酸,不包括D-氨基酸。附錄1之表4中列出的符號用于表述氨基酸的修飾形式,例如羥基化或糖基化形式。對于氨基酸的修飾形式,不得在氨基酸序列中直接使用表4中的符號表示,其具體的表述方式見本標(biāo)準(zhǔn)4.4.7節(jié)(2)和4.4.5節(jié)的內(nèi)容。
(5)序列標(biāo)識符:對應(yīng)于序列表中每個序列的序列標(biāo)識號的唯一的正整數(shù)。
(6)數(shù)字標(biāo)識符:由尖括號<>括起來的代表特定內(nèi)容數(shù)據(jù)項的三位數(shù)字。
4 序列表和序列表電子文件中的數(shù)字標(biāo)識符、內(nèi)容及其格式:
在核苷酸和/或氨基酸序列表和序列表電子文件中,應(yīng)當(dāng)有本標(biāo)準(zhǔn)中指出的數(shù)字標(biāo)識符,在數(shù)字標(biāo)識符之后(即在其之右,必要時還包括在其下面的若干行)是相應(yīng)的具體內(nèi)容,它們應(yīng)當(dāng)符合本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定的格式。附錄2給出了一個說明數(shù)字標(biāo)識符、其后內(nèi)容及格式的序列表樣例。
序列表和序列表電子文件中包括的數(shù)字標(biāo)識符及相應(yīng)內(nèi)容和格式具體如下:
4.1、序列表和序列表電子文件中的著錄項目:
下面4.1.1-4.1.7節(jié)中的內(nèi)容應(yīng)當(dāng)與專利申請請求書中的相應(yīng)內(nèi)容一致。
4.1.1、申請人的姓名或名稱:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
外國申請人還應(yīng)當(dāng)在中文譯名之后注明英文姓名或名稱,并將其用圓括號括起來。
4.1.2、發(fā)明名稱:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
4.1.3、案卷參考號:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
4.1.4、專利申請?zhí)枺浩鋽?shù)字標(biāo)識符為
對于首次提交的專利申請,無需包括此項內(nèi)容;當(dāng)補(bǔ)交或提交修改時,在數(shù)字標(biāo)識符
4.1.5、專利申請日:其數(shù)字標(biāo)識符為
對于首次提交的專利申請,無需包括此項內(nèi)容;當(dāng)補(bǔ)交或提交修改時,在數(shù)字標(biāo)識符
4.1.6、優(yōu)先權(quán)號:其數(shù)字標(biāo)識符為
沒有優(yōu)先權(quán)的專利申請,無需包括此項內(nèi)容;如果有優(yōu)先權(quán)的話,那么在數(shù)字標(biāo)識符
4.1.7、優(yōu)先權(quán)日:其數(shù)字標(biāo)識符為
沒有優(yōu)先權(quán)的專利申請,無需包括此項內(nèi)容;如果有優(yōu)先權(quán)的話,那么在數(shù)字標(biāo)識符
4.2、序列表電子文件的軟件版本信息:其數(shù)字標(biāo)識符為
當(dāng)使用國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局或其它專利組織(例如歐洲專利局)提供的軟件形成核苷酸和/或氨基酸序列表電子文件時,在數(shù)字標(biāo)識符
4.3、序列表中序列的個數(shù):其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
4.4、序列中的各項內(nèi)容:
4.4.1、序列標(biāo)識符:其數(shù)字標(biāo)識符為
在序列表中,每個序列應(yīng)當(dāng)有獨立的、唯一的序列標(biāo)識符,它應(yīng)當(dāng)從1開始并逐一增加。序列標(biāo)識符表示每個序列在序列表中的序號。
在數(shù)字標(biāo)識符
在一個序列標(biāo)識符之后到下一個序列標(biāo)識符之前是該序列的各項具體內(nèi)容,即下面4.4.2-4.4.7節(jié)的內(nèi)容。
在序列表中有多個序列的情況下,應(yīng)當(dāng)按照序列標(biāo)識符數(shù)值從小到大的次序逐一填寫每個序列的各項內(nèi)容。
4.4.2、序列的長度:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
4.4.3、序列的類型:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
4.4.4、生物體:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
4.4.5、序列中特征部分的內(nèi)容:數(shù)字標(biāo)識符
本節(jié)涉及到序列中與特征相關(guān)的內(nèi)容的表述。
在核苷酸序列(數(shù)字標(biāo)識符< 400> )中含有“n”或修飾的堿基的情況下(參見本標(biāo)準(zhǔn)4.4.7節(jié)(1)的內(nèi)容),或者在氨基酸序列(數(shù)字標(biāo)識符< 400> )中含有“Xaa”或修飾的氨基酸或不常用的L-氨基酸的情況下(參見本標(biāo)準(zhǔn)4.4.7節(jié)(2)的內(nèi)容),必須包括下面(1)-(4)項的內(nèi)容。
在生物體(數(shù)字標(biāo)識符< 213> )是“人工序列”或“未知”的情況下,必須包括下面(1)和(4)項的內(nèi)容。
在一個序列中有多個特征的情況下,應(yīng)當(dāng)按照這些特征在序列中出現(xiàn)的先后次序逐一地表述每個特征。
序列中特征部分的具體內(nèi)容和數(shù)字標(biāo)識符如下:
(1)特征:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(2)名稱/關(guān)鍵詞:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(3)位置:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(4)其它信息:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
4.4.6、出版公開信息:數(shù)字標(biāo)識符
出版公開信息是非強(qiáng)制性的內(nèi)容,在序列表和序列表電子文件中,可以包含也可以不包含這些內(nèi)容。
(1)公開出版信息:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(2)作者:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(3)題目:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(4)雜志名稱:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(5)公開出版物的卷號:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(6)公開出版物的出版號:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(7)頁碼:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(8)出版日期:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
(9)公開出版物的數(shù)據(jù)庫登記號:其數(shù)字標(biāo)識符為
如果該文獻(xiàn)被收入某個數(shù)據(jù)庫的話,那么在數(shù)字標(biāo)識符
(10)錄入數(shù)據(jù)庫的日期:其數(shù)字標(biāo)識符為
如果該文獻(xiàn)被收入某個數(shù)據(jù)庫的話,那么在數(shù)字標(biāo)識符
(11)專利公開號:其數(shù)字標(biāo)識符為
如果該公開出版物是專利文獻(xiàn)的話,那么在數(shù)字標(biāo)識符
(12)專利申請日:其數(shù)字標(biāo)識符為
如果該公開出版物是專利文獻(xiàn)的話,那么在數(shù)字標(biāo)識符
(13)專利公開日:其數(shù)字標(biāo)識符為
如果該公開出版物是專利文獻(xiàn)的話,那么在數(shù)字標(biāo)識符
4.4.7、核苷酸序列和/或氨基酸序列:其數(shù)字標(biāo)識符為
在數(shù)字標(biāo)識符
該序列可以是純核苷酸序列,或者是純氨基酸序列,或者是核苷酸序列和與它對應(yīng)的氨基酸序列。
(1)純核苷酸序列:
核苷酸序列應(yīng)當(dāng)只用單鏈表示,從左到右是5’-末端至3’-末端的方向,序列中不應(yīng)當(dāng)出現(xiàn)術(shù)語5’和3’。
應(yīng)當(dāng)用單字母代碼表示核苷酸序列的堿基來表述核苷酸序列的特征;只能使用與附錄1之表1中給出的符號相一致的小寫字母來表示。
在一個核苷酸序列中,如果經(jīng)修飾的堿基是附錄1之表2中列出的之一,那么在該序列本身中,應(yīng)當(dāng)用未修飾的堿基或“n”來表示該經(jīng)修飾的堿基,符號“n”等同于唯一的一個未知的或經(jīng)修飾的核苷酸;但在該序列的特征部分(數(shù)字標(biāo)識符
核苷酸序列中堿基的編號開始于序列中的第1個堿基,并從5’到3’方向連續(xù)地計數(shù)。該計數(shù)方法也用于構(gòu)型為環(huán)狀的核苷酸序列,在這種情況下,申請人可任意指定序列的第一個核苷酸。
來自大序列的一個或更多非鄰接區(qū)段或來自不同序列的區(qū)段組成的核苷酸序列,應(yīng)當(dāng)作為帶有單獨序列標(biāo)識符的單獨序列來計數(shù)。帶有一個缺口或多個缺口的序列應(yīng)當(dāng)作為帶有單獨序列標(biāo)識符的多個單獨序列來計數(shù),而單獨序列的數(shù)目與序列數(shù)據(jù)的連續(xù)序列的數(shù)目相同。
核苷酸序列每行最多60個核苷酸堿基,每10個核苷酸堿基后空一格。該行的最后是該行最后一個堿基的編號。
(2)純氨基酸序列:
對于氨基酸序列,蛋白質(zhì)或肽序列中的氨基酸應(yīng)當(dāng)從左到右以氨基到羧基的方向列出;序列中不應(yīng)當(dāng)出現(xiàn)氨基或羧基基團(tuán)。
氨基酸應(yīng)當(dāng)使用與附錄1之表3中的符號相一致的、第一個字母大寫的三字母符號表示。有空白或內(nèi)部中止符號(例如“Ter”或“*”或“·”)的氨基酸序列不應(yīng)當(dāng)表示為單個氨基酸序列,而應(yīng)當(dāng)作為獨立的氨基酸序列分別列出。
在一個氨基酸序列中,如果經(jīng)修飾的氨基酸是附錄1之表4中列出的氨基酸之一,那么在該序列本身中,應(yīng)當(dāng)用相應(yīng)的未經(jīng)修飾的氨基酸或“Xaa”來表示該經(jīng)修飾的和不常用的氨基酸,符號“Xaa”等同于唯一的一個未知的或經(jīng)修飾的氨基酸;但在該序列的特征部分(數(shù)字標(biāo)識符
氨基酸的編號開始于序列中的第1個氨基酸,以數(shù)字1表示并標(biāo)注在該氨基酸的下面;以后每隔5個氨基酸在其下面標(biāo)注上該氨基酸的編號。當(dāng)成熟蛋白質(zhì)之前存在氨基酸時,例如對于前-序列,原-序列,前-原-序列和信號序列而言,可以任選地從與成熟蛋白第一個氨基酸相鄰的氨基酸開始以負(fù)數(shù)往回編號。當(dāng)氨基酸編號使用負(fù)數(shù)以區(qū)分成熟蛋白質(zhì)時,不得使用數(shù)字0。上述氨基酸序列的計數(shù)方法也適用于環(huán)狀構(gòu)型的氨基酸序列,申請人可以任意指定第一個氨基酸。
來自大序列的一個或更多非鄰接區(qū)段或不同序列的區(qū)段組成的氨基酸序列,應(yīng)當(dāng)作為具有單獨序列標(biāo)識符的單獨序列來計數(shù)。具有一個缺口或多個缺口的序列應(yīng)當(dāng)作為具有單獨序列標(biāo)識符的多個單獨序列來計數(shù),單獨序列的數(shù)目與序列數(shù)據(jù)的連續(xù)序列的數(shù)目相同。
氨基酸序列每行最多16個氨基酸,每個氨基酸之間空一格。
(3)核苷酸序列和與它對應(yīng)的氨基酸序列:
對于核苷酸序列和與它對應(yīng)的氨基酸序列,對應(yīng)于其編碼的氨基酸的核苷酸序列的堿基應(yīng)當(dāng)以“三聯(lián)體”密碼子列出,每個密碼子之間應(yīng)當(dāng)空一格;對應(yīng)于核苷酸序列的編碼部分的氨基酸可以直接列于相應(yīng)密碼子的下方;對于該氨基酸序列,應(yīng)當(dāng)在第一個氨基酸的下面標(biāo)注上編號1,然后每隔5個氨基酸在其下面標(biāo)注上該氨基酸的編號。
對于這種核苷酸和其編碼的氨基酸序列的混合形式,與核苷酸序列相對應(yīng)的氨基酸序列還應(yīng)當(dāng)以純氨基酸序列的形式另外給出。
4.5 數(shù)字標(biāo)識符連同其后內(nèi)容的排列格式
在本節(jié)中,“數(shù)字標(biāo)識符及內(nèi)容”指的是數(shù)字標(biāo)識符連同其后的相應(yīng)內(nèi)容。
數(shù)字標(biāo)識符及內(nèi)容應(yīng)當(dāng)按照數(shù)字標(biāo)識符的數(shù)值從小到大的次序排列在序列表中。
每個數(shù)字標(biāo)識符及內(nèi)容之間應(yīng)當(dāng)空一行,不過在前兩位數(shù)字相同的數(shù)字標(biāo)識符及內(nèi)容之間,例如
對于序列表中有多個序列的情況,數(shù)字標(biāo)識符及內(nèi)容應(yīng)當(dāng)按照序列標(biāo)識符的數(shù)值從小到大的次序排列。在每個序列中,應(yīng)當(dāng)按照數(shù)字標(biāo)識符數(shù)值從小到大的次序列出僅僅與該序列有關(guān)的數(shù)字標(biāo)識符及內(nèi)容,即排列上從
對于一個序列中有多個特征的情況,應(yīng)當(dāng)按照這些特征在序列中出現(xiàn)的先后次序逐一排列從
5、序列表電子文件的格式
5.1、序列表電子文件是一個包含上述第4部分的數(shù)字標(biāo)識符和內(nèi)容,并符合上述第4部分格式要求的純文本文件;該文件應(yīng)當(dāng)使用中華人民共和國頒布的信息交換用漢字編碼字符集標(biāo)準(zhǔn)。
5.2、序列表電子文件應(yīng)當(dāng)記錄在CD-ROM光盤或3.5英寸軟盤上提交,或者按照國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局規(guī)定的其它形式提交。當(dāng)記錄在CD-ROM光盤上時,該CD-ROM光盤應(yīng)當(dāng)采用ISO9660標(biāo)準(zhǔn)刻錄;當(dāng)記錄在3.5英寸軟盤上時,該軟盤應(yīng)當(dāng)符合FAT 12格式。該光盤或軟盤的目錄結(jié)構(gòu)如下:在根目錄下,有且僅有一個后綴名為“.SEQ”的純文本文件。
6 其它事項
6.1、申請人應(yīng)當(dāng)保證提交的計算機(jī)可讀形式的序列表電子文件中的內(nèi)容與紙件形式的序列表完全相同。
6.2、申請人在形成符合本標(biāo)準(zhǔn)的序列表電子文件時,可以使用國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局提供的序列表編輯軟件來形成;也可以使用其它專利組織提供的軟件(例如歐洲專利局提供的Patentin)來形成;還可以使用任何純文本文件編輯軟件來形成。無論使用何種軟件,所形成的電子文件都必須符合本標(biāo)準(zhǔn)的規(guī)定。
6.3、當(dāng)申請人以光盤或軟盤的形式提交序列表電子文件時,應(yīng)當(dāng)在提交的光盤或軟盤上貼有永久性標(biāo)記,注明申請人姓名或名稱、發(fā)明名稱、光盤或軟盤中的文件名和提交日期;申請人委托了代理人的,也可以任選地標(biāo)注上代理機(jī)構(gòu)給該申請的案卷號。對于申請人補(bǔ)交或提交修改的情況,應(yīng)當(dāng)注明申請?zhí)柌⒆⒚鳌把a(bǔ)交”或“修改”。
注明申請人姓名或名稱等項內(nèi)容時,應(yīng)當(dāng)使用本標(biāo)準(zhǔn)中的數(shù)字標(biāo)識符,即應(yīng)當(dāng)標(biāo)注上數(shù)字標(biāo)識符,并在其后注明具體內(nèi)容,例如:
當(dāng)序列表電子文件的字節(jié)數(shù)太大不能記錄在一張軟盤上時,應(yīng)當(dāng)將序列表電子文件記錄在一張光盤上提交。
7 頒布和實施
本標(biāo)準(zhǔn)由中華人民共和國國家知識產(chǎn)權(quán)局頒布,自2001年11月1日起實施。
中華人民共和國國家知識產(chǎn)權(quán)局
二OO一年十一月一日
附:歐洲專利局的Patentin軟件,點擊下載(文件為zip壓縮)
附錄1核苷酸和氨基酸符號和特征關(guān)鍵詞表
表1 核苷酸表
符號 | 含義 | 名稱的來源 |
a | A | 腺嘌呤 |
g | G | 鳥嘌呤 |
c | C | 胞嘧啶 |
t | T | 胸腺嘧啶 |
r | g或a | 嘌呤 |
y | t/u或c | 嘧啶 |
m | a或c | 氨基 |
k | g或t/u | 酮基 |
s | g或c | 弱作用 3H鍵 |
w | a或t/u | 強(qiáng)作用 2H鍵 |
b | g或c或t/u | 非a |
d | a或g或t/u | 非c |
h | a或c或t/u | 非g |
v | a或g 或c | 非t,非u |
n | a或g或c或t/u,未知,或其它 | 任何 |
表2 經(jīng)修飾的核苷酸表
符號 | 含義 |
ac4c | 4-乙酰胞苷 |
chm5u | 5-(羧羥甲基)尿苷 |
cm | 2'-O-甲基胞苷 |
cmnm5s2u | 5-羧甲基氨甲基-2-硫代尿苷 |
cmnm5u | 5-羧甲基氨甲基尿苷 |
d | 二氫尿苷 |
fm | 2'-O-甲基假尿苷 |
gal q | β,D-半乳糖Q核苷 |
gm | 2'-O-甲基鳥苷 |
i | 肌苷 |
i6a | N6-異戊烯基腺苷 |
mla | 1-甲基腺苷 |
mlf | 1-甲基假尿苷 |
mlg | 1-甲基腺苷 |
mli | 1-甲基肌苷 |
m22g | 2'2-二甲基腺苷 |
m2a | 2-甲基腺苷 |
m2g | 2-甲基鳥苷 |
m3c | 3-甲基胞苷 |
m5c | 5-甲基胞苷 |
m6a | N6-甲基腺苷 |
m7g | 7-甲基鳥苷 |
mam5u | 5-甲基氨基甲基尿苷 |
mam5s2u | 5-甲氧基氨基甲基-2-硫代尿苷 |
man q | β,D-甘露糖Q核苷 |
mcm5s2u | 5-甲氧基羰基甲基-2-硫代尿苷 |
mcm5u | 5-甲氧基羰基甲基尿苷 |
mo5u | 5-甲氧基尿苷 |
ms2i6a | 2-硫代甲基-N6-異戊烯基腺苷 |
ms2t6a | N-((9-β-D-呋喃核糖基-2-硫代甲基嘌呤-6-Yl)氨基甲酰)蘇氨酸 |
mt6a | N-((9-β-D-呋喃核糖嘌呤-6-yl)N-甲基氨基甲酰)蘇氨酸 |
mv | 尿苷-5-氧化乙酸-甲基酯 |
o5u | 尿苷-5-氧化乙酸 |
osyw | Wybutoxosine |
p | 假尿苷 |
q | Q核苷 |
s2c | 2-硫代胞苷 |
s2t | 5-甲基-2硫代尿苷 |
s2u | 2-硫代尿苷 |
s4u | 4-硫代尿苷 |
t | 5-甲基尿苷 |
t6a | N-((9-β-D-呋喃核糖嘌呤-6-基)-氨基甲酰)蘇氨酸 |
tm | 2'-O-甲基-5-甲基尿苷 |
um | 2'-O-甲基尿苷 |
yw | Wybutosine |
x | 3-(3-氨基-3-羧基-丙其)尿苷,(acp3)u |
表3 三字母表示的氨基酸表
符號 | 含義 |
Ala | 丙氨酸 |
Cys | 半胱氨酸 |
Asp | 天冬氨酸 |
Glu | 谷氨酸 |
Phe | 苯丙氨酸 |
Gly | 甘氨酸 |
His | 組氨酸 |
Ile | 異亮氨酸 |
Lys | 賴氨酸 |
Leu | 亮氨酸 |
Met | 蛋氨酸 |
Asn | 天冬酰酸 |
Pro | 脯氨酸 |
Gln | 谷氨酰胺 |
Arg | 精氨酸 |
Ser | 絲氨酸 |
Thr | 蘇氨酸 |
Val | 纈氨酸 |
Trp | 色氨酸 |
Tyr | 酪氨酸 |
Asx | 天冬氨酸或天冬酰胺 |
Glx | 谷氨酸或谷氨酰胺 |
Xaa | 未知或其它 |
表3 三字母表示的氨基酸表
符號 | 含義 |
Ala | 丙氨酸 |
Cys | 半胱氨酸 |
Asp | 天冬氨酸 |
Glu | 谷氨酸 |
Phe | 苯丙氨酸 |
Gly | 甘氨酸 |
His | 組氨酸 |
Ile | 異亮氨酸 |
Lys | 賴氨酸 |
Leu | 亮氨酸 |
Met | 蛋氨酸 |
Asn | 天冬酰酸 |
Pro | 脯氨酸 |
Gln | 谷氨酰胺 |
Arg | 精氨酸 |
Ser | 絲氨酸 |
Thr | 蘇氨酸 |
Val | 纈氨酸 |
Trp | 色氨酸 |
Tyr | 酪氨酸 |
Asx | 天冬氨酸或天冬酰胺 |
Glx | 谷氨酸或谷氨酰胺 |
Xaa | 未知或其它 |
表4 經(jīng)修飾的和不常用的氨基酸表
符號 | 含義 |
Aad | 2-氨基已二酸 |
bAad | 3-氨基已二酸 |
bAla | β一丙氨酸,β一氨基丙酸 |
Abu | 2-氨基丁酸 |
4Abu | 4-氨基丁酸,哌啶酸 |
Acp | 6-氨基已酸 |
Ahe | 2-氨基庚酸 |
Aib | 2-氨基異丁酸 |
bAib | 3-氨基異丁酸 |
Apm | 2-氨基庚二酸 |
Dbu | 2,4二氨基丁酸 |
Des | 賴氨素 |
Dpm | 2,2'-二氨基庚二酸 |
Dpr | 2,3-二氨基丙酸 |
EtGly | N-乙基甘氨酸 |
EtAsn | N-乙基天冬氨酸 |
Hyl | 羥基賴氨酸 |
aHyl | 別-羥基賴氨酸 |
3Hyp | 3-羥基脯氨酸 |
4Hyp | 4-羥基脯氨酸 |
Ide | 異賴氨素 |
aIle | 別-異亮氨酸 |
MeGly | N-甲基甘氨酸,肌氨酸 |
MeIle | N-甲基異亮氨酸 |
MeLys | 6-N-甲基賴氨酸 |
MeVal | N-甲基纈氨酸 |
Nva | 正纈氨酸 |
Nle | 正亮氨酸 |
Orn | 鳥氨酸 |
表5 與核苷酸序列相關(guān)的特征關(guān)鍵詞表
關(guān)鍵詞 | 說明 |
allele
| 相關(guān)的個體或菌株含有相同基因的穩(wěn)定的其它形式,該形式區(qū)別 于這一位置的現(xiàn)有的序列(和或許其它序列) |
attenuator
|
(2)位于啟動子和第一個結(jié)構(gòu)基因之間,引起轉(zhuǎn)錄的部分終止的序列區(qū)段 |
C_region
| 免疫球蛋白輕和重鏈的恒定區(qū),和T-細(xì)胞受體α,β,和γ鏈;根據(jù)特定的鏈可 |
CAAT_signal
| CAAT盒;位于可能參與RNA聚合酶結(jié)合的真核生物轉(zhuǎn)錄單位的起始點的75bp |
CDS
| 編碼序列;對應(yīng)于蛋白質(zhì)中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括終止密碼子) |
累計代理量
城市布局
團(tuán)隊實力
服務(wù)用戶數(shù)